射精后疼痛的原因，需要根据疼痛具体的位置、程度等进行分析，具体如下：
1、炎症感染：射精后出现尿道疼痛、不适，多数是因为炎症感染。因为射精时包括前列腺、精囊都会收缩，会有前列腺液和精囊液同精液一起排出，对于患有前列腺炎或者精囊炎的患者，炎症性或带有细菌的前列腺液、精囊液，其中的细菌和细菌代谢产物会刺激尿道黏膜产生疼痛，甚至出现烧灼样、针扎样灼痛或刺痛感；
2、射精过多：如果是射精后感觉睾丸酸胀、不适，多数为比较正常的反应。尤其在性生活比较频繁时，包括多次射精后，睾丸或者阴囊区域可能有酸胀、不适，不用过于担心。