5个月的婴儿睡眠的时候摇头，常见的原因有以下几点：
1、皮疹：要检查婴儿的颜面部皮肤、头皮或者耳廓、外耳道等部位的皮肤有没有皮疹。患有皮疹的婴儿，如果出现在以上部位，通常会由于痒感刺激婴儿出现摇头的症状；
2、环境因素：如果婴儿摇头还要仔细检查婴儿是不是夜间睡眠时出汗比较多，婴儿夜间出汗比较多，有时候是环境因素，比如环境温度过热或者婴儿穿得太多，通常会导致婴儿出汗，汗液会刺激皮肤，发生痒感而出现摇头；
3、维生素D缺乏性佝偻病：婴儿患有维生素D缺乏性佝偻病，除了有多汗，还会有夜惊、睡眠不安，有骨骼 的畸形等。要及时给婴儿补充维生素D；
4、癫痫：婴儿出现摇头，还要注意是不是同时合并有规律肢体抖动等情况，要注意是不是癫痫。这时候可以带婴儿到医院完善脑电图等检查，明确是癫痫，可能要针对癫痫的分类、脑电图特点选用抗癫痫药物进行治疗。