食管高级别上皮内瘤变是癌性病变，所谓癌性病变是将发展成为癌症，但是未成为癌症，因此预后一般较好，治愈率较高。通过内镜下黏膜切除称为EMR，或内镜下黏膜剥离称为ESD，上述两种手段可以较好治疗食管高级别上皮内瘤变，治愈率可以达到90%或95%。
鳞状上皮内瘤变分为很多种，包括低级别上皮内瘤变和高级别上皮瘤变，低级别上皮内瘤变是指局限于鳞状上皮皮下1/2以内，高级别上皮内瘤变是指侵犯到食管鳞状上皮超过1/2，此类两种情况都属于较早期肿瘤，通过积极干预都可以达到根治性效果。食管高级别上皮内瘤变很多时候会显示在胃镜报告上，但一定注意活检 取到食管上皮内瘤变，并不是真正意义上食管高级别上皮瘤变，可能只是癌组织旁边早期病变。
因此胃镜做到食管上皮内瘤变，一定不要掉以轻心，需要进一步检查。有必要进行超声内镜检查，或到医院消化内科或肿瘤科进行专业胃镜检查。通过多次活检也许可以发现，在食管高级别上皮瘤变中，还有癌细胞存在。