胶囊内镜的形态与平时吃的药丸一样，但较胶囊药物略大，里面有电子摄像头，患者可以像服用胶囊药物一样，经口腔咽入食管，胶囊内镜会经过胃、小肠进入大肠，在流出过程中，胶囊内镜的摄像头会全程拍照，拍摄的照片会传输到体外接收器。
这种检查主要适用于小肠疾病，而不适用于食管、胃、大肠疾病。因为这种胶囊不可控，摄像头不能精准选择部位，所以在食管腔、胃腔、还有大肠会遗漏较多疾病。
且这种检查不能获取组织，无法明确病变性质，存在一定缺陷性。但对于一些小肠出血性病、肿瘤性疾病有一定独特优势，因为胃镜、肠镜均无法准确达到患病部位，因此只能通过 舒适的胶囊内镜检查，明确诊断。