深呼吸的时候想咳嗽，通常是因为吸入气道的气体中有刺激气道的物质。在气道有炎症的情况下，对气道产生了刺激而造成咳嗽，通常包括内因和外因。通常是气道有炎症，引起气道炎症的疾病与过敏相关，也就是嗜酸性粒细胞浸润为主的炎症，最常见的疾病是咳嗽变异性哮喘。
咳嗽变异性哮喘的特点就是夜间咳嗽、凌晨咳嗽，咳嗽会被一些刺激因素所诱发，也就是有诱因。诱因可以是冷空气、花粉、灰尘、呼吸道感染，咳嗽是阵发性的干咳。
当深吸气时，会导致气流更多地进入气道内，空气中存在的一些物质，就有可能刺激气道而出现症状。因此，一深呼吸的时候就想咳嗽，最常见的原因是咳嗽变异性哮喘。
当然，气道在有急性炎症时，也可能会出现上述症状，因为急性感染性的炎症，也会造成气道高反应，但是急性炎症的时候，一定会有急性炎症 的其他症状出现。