龟头颜色发黑原因如下：
1、正常生理现象：最常见于青春期后男性，由于青春期发育成熟后男性睾酮水平逐渐升高，容易导致生殖器官出现色素沉着、颜色发黑。青春期前后男性会出现龟头和包皮明显发育，包皮生长速度明显低于阴茎龟头生长速度，导致包皮后移、龟头外露，约70%的男性会出现龟头和阴茎明显发育，还会出现喉结变大、声音低沉、骨骼肌和身高明显变高；
2、病理现象：反复发生龟头包皮炎的男性，包皮龟头霉菌反复感染时会导致龟头表面皮肤出现片状发灰和褐色，局部会伴有瘙痒或皮疹，部分男性还会出现 包皮垢。
龟头局部发黑，需及时到泌尿外科或男科就医。