再生障碍性贫血可以分为继发性和特发性，继发性往往是明确继发于药物、放射线或病毒感染，而特发性再生障碍性贫血往往无法找到病因，但也可能是儿童已经接触毒物，但家长不记得或没有发现。引起继发性再生障碍性贫血的原因，主要包括外界刺激、个体易感性和病毒感染，具体如下：
1、外界刺激：电离辐射、核爆炸或大剂量X射线；大剂量氯霉素、抗肿瘤药物如甲氨蝶呤、环磷酰胺、阿糖胞苷等，只要剂量足够大，所有人都可以致病；
2、个体易感性：只要个体敏感即可致病，如染料、化肥、氯霉素眼药水、抗癫痫药物、抗疟疾药物 ，如果儿童对此类药物敏感，用较小剂量即可发病。
3、病毒感染：目前认为较常见的有肝炎病毒，还包括EB病毒、B19微小病毒、巨细胞病毒等，都认为和再生障碍性贫血的发生有关。