转肽酶升高通常是存在部分病理改变，包括以下几种疾病类型。各种胆道梗阻性的疾病，均可以引起转肽酶升高，比如胆管结石、胆管癌、胰头癌，均可以导致胆管堵塞，胆汁难以正常向下运行，使胆道压力升高，从而导致转肽酶的异常升高。
另外多数良性疾病，也可以导致转肽酶偏高，比如病毒性肝炎，因为肝细胞损伤导致肝内的淤胆，同样易诱发转肽酶升高，脂肪肝在中重度时，也会诱发转肽酶异常。
另外部分药物可能导致肝细胞毒性，从而诱发药物性肝损伤，进而引起转肽酶异常。此外部分自身免疫性肝病，比如原发性胆汁性肝硬化、自身免性肝炎、原发性硬化性胆管炎 ，也易导致转肽酶的异常升高。
临床上如果发现转肽酶存在偏高的情况，建议进行全面的肝功能筛查、病毒指标的检查、肝胆超声，结合这些指标进行综合判断，查明原因采取有针对性处理。