部分川崎病的患儿确实可以自愈，体温经过积极的抗感染治疗可以自行降到正常，临床症状也可以逐渐自行恢复。但是要监测冠状动脉炎症的情况，评估冠状动脉炎是否继续增加，或进一步加重的趋势。川崎病的患儿要定期去监测症状、实验室指标，比如白细胞、中性粒细胞比值、C反应蛋白、血沉等。 同时一定要定期地监测心脏彩超和冠状动脉超声，早期发现川崎病是否合并冠状动脉的病变。
一旦发现川崎病合并了冠状动脉的病变，即使川崎病患者的体温已经降到正常，也建议积极给予川崎病正规的丙种球蛋白联合阿司匹林治疗，对冠状动脉病变的恢复和保护会有非常重要的临床意义。因为一旦冠状动脉病变没有得到及时的诊断或治疗，后期可能会发生严重的冠状动脉病变，比如巨大的冠状动脉瘤，会影响患儿的预后。