磷霉素氨丁三醇散一般情况下不会引起大便隐血，但长期服药可能会出现大便潜血。由于患者长期服用此药品会引起肠道菌群失调，使艰难梭菌过度生长，导致艰难梭菌相关性疾病，出现腹泻、水样便，甚至血便，患者常伴有恶心、呕吐、消化不良、便秘等消化系统的其它不良反应。除此情况外，以下原因也可能会导致大便隐血：
1、消化道出血：如胃溃疡、十二指肠溃疡、结肠炎、直肠息肉等疾病，可能伴有呕血、便鲜血等症状；
2、消化道癌症：早期或晚期均可能出现大便潜血；
3、肛门及肛周病变：如痔疮、肛裂等，通常表现为鲜红 样便血、肛门疼痛难忍或者肿胀等症状；
4、细菌性痢疾：通常患者有发热、腹痛、脓血便等表现。
因此，如果患者在服药期间，出现上述情况时应及时就医，在医生指导下根据不同的症状、表现，选择进行大便潜血、X线、钡餐、胃镜、肠镜、细菌培养等各项检查，确定病因以后，再进行下一步处理。