巩膜发蓝的主要原因如下：
1、巩膜组织薄弱：透过巩膜可观察到巩膜内脉络膜的颜色，为主要原因。临床上3岁以下的新生儿，尤其是早产儿，通常有巩膜发蓝现象，原因在于巩膜组织较薄、结构不良，便可观察到该现象。通常3岁以上患者，随着巩膜组织增厚、致密后，此现象便会消失；
2、巩膜炎症：导致巩膜组织结构改变，从而使巩膜变得较薄弱，透过巩膜后也呈现蓝色表现，局部炎症同样会造成巩膜发蓝；
3、全身营养性因素：如缺铁性贫血，对于这部分患者而言，同样可能造成巩膜组织发育问题，如巩膜组织结构不良，从而导致巩膜发蓝表现。
综上，只要是3岁以上患者出现巩膜发蓝，提示可能存在病理因素，需找到巩膜发蓝的原因，针对病因进行相应治疗。