做宫腔灌注什么时间最合适，要根据做宫腔灌注的目的来决定，所以做宫腔灌注什么时间最好，还是要根据自身存在的具体的问题，以及实施宫腔灌注的目的来决定。
1、进行胚胎移植：如果是为了进行胚胎移植，为了使子宫内膜长到合适的厚度，可以在月经干净以后3-7天的时间来实施；
2、刺激子宫内膜：如果是为了移植之前刺激子宫内膜，使它血流得到改善，一般是在移植之前2-3天的时间，或者提前1天的时间，来实施宫腔灌注的手术；
3、治疗子宫内膜炎症：如果是为了治疗子宫内膜的炎症，只要不在来月经期间，什么时间来进行都可以。
经常用于宫腔灌注的药物，包括粒细胞集落刺激因子、绒毛膜促性腺激素，还包括其他的成分的不同药物，做宫腔灌注的不同的时间，它对子宫内膜的作用也不同。