卵巢囊肿穿刺一般在B超引导下进行，可产生一定的疼痛。具有感染的可能性，由于为有创操作，临床常见患者术后出现盆腔感染，即盆腔炎。此外，可导致较严重的出血，通常为穿刺导致血管破裂出血，临床上较为少见。一般卵巢囊肿是生理性，对个人健康没有影响，不必特殊处理。若囊肿增大到5cm或者5cm以上，或持续增大，可采用穿刺的方法解决。
临床上患者由于卵巢功能下降或内分泌失调，不能正常排卵，可采用促排卵药物促进排卵，但部分卵泡成熟后不能自然破裂，便不能受孕。临床上为使卵泡破裂、受孕，可打破卵针促进排卵。若卵泡仍不能破裂，可形成生理性 囊肿，即卵巢囊肿，一般对患者健康无影响，不需特殊处理。若卵巢囊肿越来越大或超过5cm，可通过卵巢囊肿穿刺消除囊肿。