在临床上，确实见到肝囊肿相对比较大，或者囊肿比较靠近肝脏的边缘引起不适或压迫症状，这时候可能就需要处理。对于肝脏囊肿的处理，可以采用的办法包括在超声引导下对其囊液进行抽取；对于一部分肝囊肿的患者，可能需要考虑手术切除。对于一部分患者，如果合并肾囊肿，又有肝囊肿，病情比较严重时，需要考虑到肝移植的情况，但是绝大部分的肝囊肿都不需要特殊的处理。
肝囊肿是在临床上比较常见的肝脏占位性病变，肝脏的占位性的病变分很多种，包括肝囊肿、肝血管瘤、肝癌和其它少见的肝脏肿瘤等。而肝囊肿是相对比较良性的一种疾病的病症，只需要定期检查，而且肝囊肿一般也不会出现恶变，成为恶性肿瘤等。