目前临床并没有和莫匹罗星软膏效果一样的软膏，但莫匹罗星软膏和夫西地酸乳膏、红霉素软膏、复方多粘菌素B软膏的效果类似。莫匹罗星软膏是局部外用的抗生素，适用于革兰氏阳性球菌引起的皮肤感染，如脓疱病、疖肿、毛囊炎等原发性皮肤感染，以及湿疹合并感染、溃疡合并感染、创伤合并感染等继发性皮肤感染。虽然目前没有与莫匹罗星软膏效果一样的软膏，但某些外用抗生素的软膏，如夫西地酸乳膏、红霉素软膏、复方多粘菌素B软膏等可以局部涂抹的外用抗生素，抗菌谱与莫匹罗星软膏类似，均可适用于革兰氏阳性菌引起的皮肤感染。
但需要注意的是每种软膏各有特点，如红霉素软膏对敏感革兰氏阳性球菌所致的感染效果较好，而莫匹罗星软膏和夫西地酸乳膏，除对敏感阳性球菌所致的皮肤感染有效外，还可以对有耐药性革兰氏阳性球菌所致的皮肤感染有效果。另外，复方多粘菌素B软膏除对阳性球菌引起的感染有效外，还对阴性杆菌所致的感染有效，因此适用于混合型细菌所致的皮肤感染性疾病治疗。