头颅MR平扫指颅脑磁共振成像检查，平扫即不用注射造影剂，主要用于观察脑部有无病变，能明确病变是否是脑组织结构发生改变所导致。相比于CT，头部MRI对脑内结构显示更加清晰，也能更敏感、准确。在所有医学影像检查手段中，MRI软组织分辨率最高，具有任意方向直接切层能力，而不必变动检查者体位。磁共振无创伤、无辐射，对脑组织无损伤也没有生物学损伤，避免X线或放射性核素显像等影像检查所致损伤。
磁共振比CT更早发现病变，特别是能发现脑脱髓鞘性病变、脑炎、感染性病变，早期发现缺血性病变及低度星形细胞瘤，对后颅窝和脑干等处小病变能显示满意，对颅骨顶部和矢状窦旁、外 侧裂结构和广泛转移瘤有很高诊断价值。磁共振有较高图像分辨率，可以得到更清晰脑部成像。