幽门螺杆菌是一种致病菌，其危害主要是引起胃黏膜的炎症，如长期感染，可由慢性非萎缩性胃炎变成萎缩性胃炎。有一些病人还会出现肠上皮化生、异型增生。而且幽门螺杆菌感染的病人，相对于未感染者，其胃癌发生率高。但并不是有幽门螺杆菌感染一定会产生胃癌，只是其发生胃癌的可能性会相对较大，所以不必过度担忧。
临床可通过胃镜检查，了解胃部情况。如只是一般性感染，在根除幽门螺杆菌后，即可控制感染。即在根除幽门螺杆菌后，可抑制胃炎的继续发展，减少胃癌的发生。除此之外，幽门螺杆菌感染，可能还会引起其它疾病，第一类是血液系统疾病，如血 小板减少等。第二类是皮肤系统疾病，如过敏性皮肤病等。