奶粉实际是由牛奶经真空干燥而成的粉剂，因此奶粉过敏即为牛奶过敏。由于婴幼儿免疫系统尚未发育完善，导致其发生免疫识别误差，机体将牛奶中营养物质作为攻击目标，从而造成口服牛奶不耐受情况。牛奶过敏原理是婴儿对牛奶中蛋白质过敏，而牛奶中含有多种蛋白质，其中可引起过敏的主要过敏原是α-乳清蛋白和β-乳球蛋白。
婴幼儿发生食物过敏的发病率高于成人，而牛奶作为人工喂养婴儿的主要食物，过敏发生率大致在2%-6%且多数为1岁以内的婴儿。牛奶过敏源于免疫系统原理，即婴儿机体免疫系统 将外来的蛋白质视为“敌人”，运用各种免疫反应对抗蛋白质，从而出现过敏反应。