近视眼手术分为角膜屈光手术和有晶体眼人工晶体植入术，角膜屈光手术的安全性优于有晶体眼人工晶体植入术，目前认为角膜屈光手术中的全飞秒激光手术是安全的视力矫正手术。因为全飞秒激光手术在整个手术过程全部使用飞秒激光，切削精准，对角膜损伤比较小，且全飞秒激光手术不制作角膜瓣，直接通过飞秒激光在板层角膜切削镜片，通过2mm的小切口把镜片取出，不易感染，不制作角膜瓣则不容易发生瓣下浑浊、感染以及瓣复位不良。
总体而言，全飞秒激光手术可以有效降低角膜屈光手术并发症的可能性，使患者获得比较好的手术矫正效果。所以全飞秒激光 手术优于其他角膜手术方式，符合角膜激光手术治疗范围的患者，可以通过全飞秒激光手术获得安全的手术效果。