贲门癌中期和中晚期同样的手术效果有区别，分期越早手术效果越好。在较大的医疗单位，手术的成功率通常在90%-95%以上，也就是说失败率相对较低，死亡率一般会控制在1%-3%以下，如果是Ⅲ期手术以后的效果可能会差一些。而如果疾病的分期更晚，则不适合选择进行手术治疗，而应采取非手术治疗方法，比如化疗或结合放疗、免疫治疗或者中药治疗等。
对于贲门癌的患者首先要经过胃镜确定贲门癌的范围、大小、病理类型，并且经过CT或者核磁共振判断局部肿瘤是否发生外侵。如果存在外侵的情况，则需确认外侵的程度，是否存在腹腔或者胃小弯淋巴结的转移，以及评估其它部位有无转移，如果没有发生转移，这种情况下可以进行手术。