虽然儿童甲流、乙流与新型冠状病毒合并感染的可能性很低，但一旦感染了，容易加重病情，并且儿童相对于成人更易合并感染。患儿可以遵医嘱使用抗病毒药物进行治疗，同时可以联用中成药治疗，多重靶点抗病毒，针对合并感染均有良好的效果。
1、在抗病毒药物选择上：可以使用奥司他韦、帕拉米韦等药物进行治疗。其中奥司他韦适用于1岁及1岁以上的甲型和乙型流感的治疗；帕拉米韦是静脉注射制剂，适用于婴幼儿的使用。可以帮助抑制病毒的复制和生长，从而减轻症状并促进康复。具体用药方案，请遵循医生的指导；
2、在中成药的选择上：如常用的新费乐小儿肺热咳喘颗粒，能清肺热、抗病毒，可用于普通感冒，亦可用于流感的治疗，可以减轻甲流、乙流与新型冠状病毒合并感染导致的咳嗽、发热、咳痰等不适症状，有助于缩短症状持续时间 。并且，该药经过进一步研制在疗效、口感等方面进行了优化，较适合儿童服用，口味是水果味，患儿容易接受。另外，小儿清咽颗粒、橘红痰咳颗粒等对减轻症状也有一定帮助。部分儿童感染后可能导致气道变得更加敏感，进而出现过敏性咳嗽，这时需要抗过敏药物来进行治疗。
除了服用药物，还可通过雾化吸入治疗减轻感染导致的咳嗽、咳痰症状。另外，生活中家长还要注意让患儿保证充足的睡眠、饮食均衡，勤洗手、戴口罩等，尽量避免去人员密集的场所。同时需要遵循医生的建议，按时服药、定期复查，及时控制病情。