当出现细菌和霉菌混合感染时，用药一般考虑先使用针对霉菌的药物，因为在检测出现霉菌时，检测结果相对比较确定。但当有霉菌感染时，对于细菌性阴道炎的检查准确度较差，即有时仅为单纯霉菌感染，但由于检测技术原因，体现为混合感染情况，未必是真的混合感染。
目前针对霉菌性阴道炎治疗的药物，如克霉唑药片，含有乳酸杆菌成分，在使用药物治疗霉菌同时，也有利于恢复阴道环境，可以兼顾细菌性阴道炎的治疗。所以通常当出现霉菌和细菌混合感染时，可考虑使用含有乳酸杆菌的克霉唑片进行治疗，多数患者可以好转。如果复查时仍存在细菌感染，可再针对细菌进行治疗。