目前试管婴儿技术在近30年的时间内在中国发展非常快，因此问题集中在通过通过试管婴儿生育的孩子跟自然生育的孩子是否存在区别。目前全世界的大数据看到试管婴儿生出的小孩健康质量与自然受孕的小孩的健康质量以及流产率等各方面一致。
但最近这几年通过更多数据分析提示试管婴儿生出的小孩患有代谢性疾病的几率要比自然受孕的小孩偏高，因此患有代谢性疾病相关人群生育的子代里面患有代谢性疾病比例更高。
而因为女性输卵管堵塞造成精卵不能结合，或男性是因为感染或结扎导致精子无法射出等选择进行试管婴儿，在夫妻身体健康正常，没有 基因突变的情况下，这类患者的后代相对患病风险更低。