结肠癌化疗相对胃癌化疗痛苦稍轻。因为结肠癌所应用的化疗药物，比如伊立替康、奥沙利铂和5-氟尿嘧啶等，相对而言副反应不是太强，对于70%左右的患者均有效果。
化疗后也有部分患者会存在胃肠道反应、白细胞水平下降和肝肾功能损伤。但是相对于其它瘤种的化疗，结肠癌患者化疗的副作用相对较少，而且能够耐受的患者较多。所以患者的依从性较高，医生建议结肠癌患者要坚持化疗。
所以，结肠癌患者化疗是否痛苦取决于患者的具体情况。部分偏晚期的患者可能会配合应用靶向药物，而部分患者可能会出现皮疹、腹泻等，若治疗及时则并无大碍。