胃肠造影根据部位不同，诊断疾病也不同。胃肠造影分胃-十二指肠造影，小肠造影以及钡灌肠，胃-十二指肠造影，基本上能看到食道，胃-十二指肠球部以及颈部，通过上消化道胃肠造影，可以很明显的看到炎症、溃疡、肿瘤、憩室或者动力异常。小肠造影看到的疾病相对有限，主要看炎症、肿瘤、胃肠道动力，以及是否先天发育异常，钡灌肠主要查看肠道炎症、憩室、肿瘤以及动力异常。
胃肠道造影是通过X光判断疾病，不像胃肠镜检查比较直观，比较小的病灶有时容易造成疏漏。但胃肠道造影有胃肠镜无法替代功能，即检查胃肠道动力。所以，患者如果有胃肠道动力异常，胃肠造影是不错的选择。