沙眼早期症状类似于结膜炎，患者眼睛可能出现充血或者磨痛，以及分泌物增加。慢性晚期的沙眼患者可能存在沙眼后遗症，包括眼睛内翻、倒睫、结膜瘢痕、干眼。针对早期沙眼患者可以使用抗生素进行治疗，晚期沙眼患者主要针对沙眼后遗症进行相应治疗。在现代卫生条件改善的情况下，真正的沙眼患者已经越来越少。
沙眼与普通细菌性、病毒性感染不同，是由衣原体所引起，所以需要加强个人卫生，因为沙眼可以通过接触进行传染。所以对于早期沙眼患者可以通过眼科检查，尤其是针对沙眼衣原体的检验，查看是否存在包含体或衣原体分离而进行确诊。对于晚期沙眼患者会出现结膜瘢痕、内翻、倒睫毛，或者角膜出现血管翳，是辅助诊断沙眼的方法。