尿液检查时，小圆上皮细胞的正常值为无，或者极少量存在。小圆上皮细胞对于尿液中细胞从大小和形态描述，并不指哪种具体细胞，往往涵盖有多种细胞，常见是肾小管上皮细胞和底层异型上皮细胞，光镜下难以区分的时候，则从形态学和大小予以描述，主要如下：
1、肾小管上皮细胞：来源于远曲小管或近曲小管，如果在尿液中出现，通常提示存在肾小管病变，对于肾移植患者术后进行尿常规检测，肾小管上皮细胞主要是监测是否存在排斥反应；
2、底层异型上皮细胞：属于异型上皮细胞，异型上皮细胞分为表层、中层和底层，表层来源于膀胱，中层来源于肾盂，而底层异型上皮细胞来源于输尿管、膀胱和尿道，正常情况下是不存在，如果在尿液中出现，考虑存在泌尿系统感染的可能，上尿路和下尿路可能发生感染。如果在尿液中大量出现底层异型上皮细胞时，患者需要警惕是否存在异型上皮细胞癌。