急性感染性腹泻的处理原则，包括一般治疗和对症治疗。一般的治疗包括饮食调整，比如急性期要进食流质或者半流质的饮食，避免进食乳制品，同时注意休息及补充水分和电解质。根据脱水的程度，如果轻度脱水可以选择口服用药，如口服补液盐。如果是中度以上或者重度脱水，可以选择静脉补液。
引起腹泻的细菌有霍乱、菌痢、伤寒、副伤寒等肠道传染病，这些细菌引起腹泻需要正规的抗感染治疗，而且还要注意防控、避免播散。除此之外还有沙门菌、大肠埃希菌、或者是弯曲菌、变形杆菌等细菌引起腹泻。对于以上的细菌性腹泻，很多都是自限性，不需要常规的应用抗菌药物。多数患者是可以通 过一般对症治疗，补充水电解质以后好转。如果对于有免疫缺陷或者3个月以下的婴儿，或者是合并败血症、脓毒症的情况，需要正规的应用抗菌药治疗，至于用的抗菌药物或者抗菌药的疗程，需要专业的医生指导。