初期甲沟炎一般可以用消毒剂消毒，如碘伏、酒精，另外可以使用抗生素，包括口服和外用。当然可以使用促进伤口愈合的药物，像局部涂抹鱼石脂软膏。
甲沟炎早期主要是炎症形成的早期，主要是以控制炎症、消除肿胀、避免进展为主要目的，所选用的药物也主要是针对这些症状而使用。一方面使用皮肤黏膜消毒剂，如碘伏以及酒精。另一方面针对炎症使用消炎药物，包括口服消炎药物，像头孢，或者外擦消炎药物。当然，外擦的消炎药膏不要长时间使用，容易产生耐药性。在临床上还可以使用鱼石脂软膏，涂抹在局部，主要是起到炎症收敛、避免扩散、加速炎症吸收和消散的作用。另外，对于甲沟炎，也可以外擦其他药膏，像消肿的药膏，使局部消炎和消肿的作用起效更快。