在临床上能够遇到部分患者，尤其是没有做过针灸治疗的患者，在给其头部扎针的时候特别害怕，害怕会扎伤脑子和神经，其实这种担心是多余的。一般以正确的治疗方式进行操作，不可能扎进颅内和神经。
但是，有一些禁忌和注意事项，比如治疗儿童患者的囟门时，如果囟门没有闭合，局部是不能扎针的。针法万一不顺，有可能扎进脑子。
此外，颈部、枕部有一些特殊的穴位，比如哑门穴、风府穴、风池穴、天柱穴等穴位，在临床上，也要按照正规的操作，千万不能有偏差。对于部分患者而言，如果扎得不对，有可能扎到脑干、 延髓，极个别患者会引起昏迷，部分患者会出现危险情况。