差异性紫绀见于晚期动脉导管未闭患者，形成肺动脉高压而产生右向左分流的情况，差异性紫绀治疗如下：
1、手术及介入治疗：对于形成差异性紫绀患者，提示明显肺动脉高压，应积极进行原发疾病及动脉导管未闭治疗。可行外科手术或介入治疗闭合肺动脉导管，避免病程进一步进展，加重肺脉高压、差异性紫绀，影响周身各重要脏器组织的氧合灌注；
2、药物治疗：针对已形成的肺动脉高压，酌情应用相关治疗药物，包括靶向药，如波生坦、安立生坦等，也包括一些相关的前列腺素药物。4种药物一定程度上可降低肺动脉压力，缓解差异性紫绀。
但对于出现差异性紫绀患者，多为动脉导管未闭晚期患者，上述治疗效果较差。对于此病，预防大于治疗。临床检出动脉导管未闭患者，应积极进行手术纠正，避免后期产生肺动脉高压，出现差异性紫绀，造成治疗困难。