心内膜垫缺损属于复杂畸形，通常无法自行恢复。正常的心脏结构类似于田字，心内膜垫指中间的十字，如果龋损，必须通过手术的方式修补，才可达到治愈目的。心内膜垫缺损分为完全型心内膜垫缺损和简单型心内膜垫缺损，简单型心内膜垫缺损即部分型心内膜垫缺损，部分型心内膜垫缺损症状较轻，一般在患者4-5岁时会发现。
完全型心内膜垫缺损属于比较复杂的畸形，需要及早处理，通常在患儿3-4个月时即可做手术。首先需修补瓣膜，如修补存在裂隙的二尖瓣，其次需修补室间隔缺损和房间隔缺损，上诉操作均需通过体外循环心内直视手术才能完成。