肝占位良性或恶性区分的方法主要包括临床病史、肿瘤标记物筛查、特异性的影像学表现、肝脏占位的病理学诊断等。在肝脏上可以生长良性肿瘤，同样也可以生长恶性肿瘤，或者是身体其他部位的恶性肿瘤转移到肝脏。肝脏良性肿瘤包括肝血管瘤、局灶性结节样增生、肝脏的囊肿，肝脏恶性肿瘤则包括原发性肝癌、转移性肝癌，介于肝脏良性、恶性之间的具有潜在癌变风险的有肝腺瘤、肝囊腺瘤等。
原发性肝癌患者大部分都是在既往有肝炎病毒感染、长期饮酒、严重的脂肪肝基础之上形成。肝脏良性疾病通常没有慢性肝病的病史，肿瘤标记物包括甲胎蛋白、CA19-9，肝脏恶性肿瘤大多会出现异常的升高，而良性占位指标通常为正常，影像学对于肝脏良性和恶性占位，如CT、核磁诊断的准确率和特异性都可以达到90%以上，必要时还可以通过肝脏占位，穿刺、活检 来确认其病理性质。