甲亢的患者，会随着高T3、T4的症候群对胃肠道的作用，主要是使胃肠蠕动比较快，可能会出现排便次数增加。早期可能只是成型大便次数增加，但对于腹泻引起的肠内容物改变基本上存在。
甲亢腹泻与痢疾或者感染性腹泻的胃肠功能相比是不一样的，一般不会出现脓血、黏液也不会有里急后重。甲亢腹泻突出表现，还是胃肠功能比较快，从而造成食物没有经过非常好的消化功能就排出了。
部分患者，可能开始出现便秘，甲亢以后排便次数明显地增加，基本上还是成型的大便，有时部分患者也会出现多食，但因为胃肠蠕动速度非常快，患者饥饿的感觉会非常重，经常也会有肠鸣音比较活跃的突出表现。
同时胃排空比较快，胃肠蠕动也比较快，所以患者大便次数与基线相比，会明显增加，原来每天只排1次大便，现在每天可能2、3次或3、4次。
甲亢腹泻是排便次数增加，可能与胃肠炎造成的腹泻，不完全一样。