阿米巴角膜炎指棘阿米巴原虫感染角膜导致的角膜炎，阿米巴原虫是微生物的一种，是一种原虫结构，一阿米巴存在于水质中，比如自来水等，很容易受到阿米巴原虫污染，可能在角膜有伤口时，经常配戴角膜接触镜，也就是隐形眼镜人群中，因清洁眼睛不及时，由污染自来水污染隐形眼镜，配戴隐形眼镜时接触角膜，导致角膜感染。
上述途径是常见方式，或本身角膜上皮疾病，比如长期肝炎症病人或角膜上皮糜烂患者，接触污染自来水后，也易感染阿米巴角膜炎。但阿米巴角膜炎不常见，必须受阿米巴污染自来水感染角膜，会导致阿米巴角膜炎。阿米巴角膜炎患者较明显症状是特别疼，视力下降。