男生阴茎部位长痘痘的原因如下：
1、细菌感染：常见阴茎部位毛囊皮脂腺有细菌感染，出现发炎形成痘痘。产生原因包括内因、外因。外因是局部阴茎部皮肤清洁卫生较差，潮湿多汗容易滋生细菌，导致痘痘形成。如果局部本身存在皮肤病，如湿疹，反复搔抓刺激使皮肤破损，也容易出现细菌感染。内因指平时饮食方面不注意，进食过多辛辣、刺激性食物，导致毛囊皮脂分泌增加；
2、基础疾病：如糖尿病或肝肾疾病，免疫力较低也容易长痘痘；
3、性病：尖锐湿疣，主要通过不洁性行为感染人乳头瘤病毒引起。表现为男性阴茎部位出现单个、多个，如小肉芽一样的质地柔软的丘疹，可以随着时间逐渐生长，建议及时就医诊断、治疗，避免反复发作或传染他人，引起严重后果。