阴道口长水疱，最常见于生殖器疱疹病毒感染。生殖器疱疹病毒感染最常见于单纯疱疹病毒Ⅱ型感染，通常会在外生殖器表面形成多发水疱改变，水疱破裂后会形成局部渗液和局部疼痛症状，创面感染后还会出现局部分泌物。
单纯疱疹病毒感染引起的生殖器疱疹病毒，通常需要口服阿昔洛韦治疗，阿昔洛韦对单纯疱疹病毒感染有较好的疗效，局部还可以涂抹阿昔洛韦乳膏，对外生殖器单纯疱疹病毒感染有较好的治疗效果。万乃洛韦对单纯疱疹病毒感染也有较好的治疗效果，口服万乃洛韦后，可以明显地改善病毒感染引起的疱疹症状，可以明显地减轻局部疼痛症状 。
阴道口长水疱，还可以口服更昔洛韦治疗，更昔洛韦也是抗病毒药物，对单纯疱疹病毒、带状疱疹病毒感染都有较好的治疗效果。阴道口长水疱还需提高免疫力，当人体免疫力下降后就会出现病毒感染，所以增强免疫力后，上述症状会明显改善。