儿童生殖器发红首先考虑是否存在龟头包皮炎，因为儿童一般合并包皮过长或包茎，同时不注意清洁卫生，容易出现外生殖器发红。此类情况建议外用药物治疗，可以使用1:5000的高锰酸钾溶液或碘伏消毒药水稀释后温水清洗、浸泡，每日2次，然后再外用红霉素药膏涂抹。同时饮食上需要注意避免进食辛辣食物，多饮水，已达到利尿的目的。平常注意个人卫生，每天清洗外阴，将包皮外翻清洗，同时注意保暖，不穿开裆裤，避免反复发作，尽可能穿宽松棉质内裤。
如果男孩生殖器发红，且伴有尿频、尿急、尿痛、排尿哭吵、排尿困难等症状，临床需警惕合并尿路感染，需要及时就医，化验尿常规。如明确存在尿路感染，需外加口服抗生素正规治疗。临床上部分患儿是由于皮肤娇嫩、皮肤过敏，特别是长时期穿尿不湿后，尿液接触，导致尿布疹，或过敏体质造成会阴部湿疹，此类情况需要勤换尿不湿，尽量保持会阴部透气，严重时需要局部使用治疗湿疹的药膏。