甲状腺滤泡上皮细胞能分泌甲状腺球蛋白，如果甲状腺发生病变，比如炎症、结节、肉芽肿、肿瘤、受到射线、外伤等损害时，滤泡就被破坏，此时部分滤泡损害可以自愈。比如亚急性甲状腺炎导致炎症细胞浸润滤泡上皮细胞崩解、滤泡破坏，使滤泡内储存的甲状腺素释放入血，造成一过性甲状腺毒症。但是一般炎症控制、消退以后，组织局部就会纤维化、痊愈，病灶间会出现新的小滤泡，此时生长因子就会调节甲状腺腺泡和血管生成，促进甲状腺组织恢复正常，最终完全缓解、恢复功能。
但是对于部分疾病，比如桥本甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎、放射性甲状腺炎、晚期 甲状腺癌、亚急性甲状腺炎，会导致甲状腺组织萎缩或者永久性破坏，这些情况下滤泡则不能完全恢复，此时部分患者会出现永久性甲状腺功能减退。