椎管内占位术后并发症根据肿瘤性质、位置不同，以及手术危险性，术后并发症也不同。椎管内肿瘤手术最大术后并发症是损伤脊髓，肿瘤与脊髓粘连致密界限不清晰，或者为肿瘤组织供血血管非常丰富，都会给切除肿瘤带来困难，增加损伤脊髓风险。一旦脊髓受到损伤，将导致患者出现不可逆的神经功能障碍，如出现肢体麻木无力、大小便功能障碍，甚至造成永久残疾。髓内肿瘤要切开脊髓，在脊髓内部分离肿瘤，比髓外硬膜下肿瘤手术难度要大，风险要高。
另外，手术时不可避免会牵拉刺激神经或者脊髓，严重者可导致偏瘫、大小便困难、下肢刺痛等并发症。同时如果负责手术的神经外科医生技 术精湛、经验丰富，上述问题发生几率并不太高，患者不必过度担忧。