肝功能异常本身是一个笼统的说法，反映肝功能损害有很多指标，而肝功能异常是总称。对于肝功能而言，反映肝细胞损伤的指标包括谷丙转氨酶、谷草转氨酶。反应胆管上皮细胞损伤的指标包括转肽酶，甚至碱性磷酸酶，同时反映肝功能损害。而反映肝功能代谢的指标为胆红素，有的患者在肝损伤同时会出现胆红素水平的升高。
还有反映肝脏合成功能的指标，如人血清当中的白蛋白检测、前白蛋白检测、胆碱酯酶检测，甚至胆固醇检测，这些指标都可以反映肝脏合成的功能。肝功能损害是一个笼统的说法，而除了肝细胞损伤造成的转氨酶升高以外，还有肝脏合成功能异常 、肝脏代谢功能异常，这些指标均可反映肝功能异常。