臭氧治疗滑膜炎时，由于穿刺而出现部分相关并发症即其治疗的部分副作用，如穿刺局部的感染，可能会造成滑膜炎以外更加严重的后果。而臭氧治疗从整体上，在安全操作的前提下，对于滑膜炎有一定治疗作用，臭氧通过氧化作用消除部分关节滑膜上的无菌性炎症，对于部分患者，可以起到较好的消炎、镇痛的效果。
但臭氧治疗仅可以作为辅助治疗，而且只是对部分患者有效果，对于比较明显的滑膜炎患者，必须要辅助一系列其他处理。
如在滑膜炎急性期，建议患者卧床、制动、休息，尽量减少活动和关节负重，可以配合口服消炎镇痛类药物，如塞来昔布、乐松(洛索洛芬钠片)等，还可以配合外用膏药、热敷等，可以让局部的水肿、炎症吸收。
而对于合并其他骨关节炎、半月板损伤以及膝关节游离体的患者，可以采取微创关节镜手术的方式去解除关节内的相关病变。
如果微创治疗效果不好的情况，可以进行人工关节表面置换，在进行骨膜修复的过程中，再进一步去解除炎症的滑膜组织。