载脂蛋白B偏低的原因较多，临床上常见的有遗传、肝功能受损、使用降脂药物等，具体如下：
1、遗传：有的家族存在先天性的载脂蛋白B偏低，且遗传也是导致脂蛋白B偏低的重要原因；
2、肝功能受损：因为载脂蛋白B主要是在肝脏内合成，若肝功能异常的患者，特别是严重的肝衰竭患者体内的载脂蛋白B偏低；
3、使用降脂药物：使用降脂药物可导致载脂蛋白B偏低，特别是大量使用他汀类药物，因为载脂蛋白B在药物作用下会明显降低；
4、其他原因：除上述原因外，严重营养不良的患者、恶性肿瘤晚期的患者也可出现载脂蛋白B偏低的情况。
但载脂蛋白B偏低实际上对于心血管领域是一个好的事情，因为载脂蛋白B主要存在低密度脂蛋白中，而低密度脂蛋白是一种坏的胆固醇，因为低密度脂蛋白容易引起动脉粥样硬化斑块。因此，心血管医生是希望患者的载脂蛋白B偏低。