三叉神经痛涉及多学科的治疗，需要许多学科共同协作完成治疗。目前三叉神经痛涉及到的学科主要有口腔科、神经内科、神经外科、疼痛科，每个学科都有其特点。患者初次就诊科室最常见于口腔科、神经内科，因为患者经常表现为面部、牙龈、牙齿的疼痛，所以往往会到口腔科就诊。口腔科医生经过检查之后发现牙齿没有问题，疼痛的性质又不同于一般的牙痛，会推荐患者到神经内科去治疗。但也有部分口腔科医生可能对三叉神经痛的认识不足，可能会推荐患者进行牙科治疗。经治疗之后，患者效果肯定不理想，最后患者还会去神经 科就诊。
对于初发三叉神经痛的患者，神经内科医生多会推荐患者使用三叉神经痛的药物，比如卡马西平。患者经过药物治疗以后，若效果不理想，可以再去疼痛科或者神经外科就诊。疼痛科最擅长的治疗方法是射频治疗，即对面部痛觉神经进行毁损。这种治疗方法的优点是比较微创，缺点是相对复发率比较高，而且会遗留面部麻木的后遗症。神经外科的优势是微创手术，所以三叉神经痛患者的治疗需要多学科共同协作完成。