免疫组织化学染色是病理科的辅助检查手段，通常情况患者的疾病不是特别典型，或者疾病在病理上难以进行分型时，会用免疫组织化学染色的方法来辅助诊断。
免疫组织化学染色是抗原抗体的染色方式，是用已知抗体去检测组织当中未知抗原。组织中有不同的抗原表型，每个疾病的蛋白表达可能不同，通过不同抗体去检测组织当中不同抗原，来提示这是什么组织来源的疾病，或者通过什么蛋白的表达进行组织来源分类。
除组织来源之外，还可进行肿瘤细胞的预后或者肿瘤细胞进展预测，比如一些抗原抗体Ki67或者PCNA，可检测肿瘤细胞的分裂速度或者增殖表达，对于肿瘤进展和浸润情况进行预测。