种植牙放二期基台通常没有疼痛。种植牙一期手术即放种植体手术，创伤比二期放愈合基台大，通常一期放种植体的过程，都可以保证患者不出现疼痛。而种植牙二期手术更简单，所以对于种植二期手术患者不用过于担心，创伤和不适要远小于一期手术。此外二期手术切口较小、翻瓣较小、手术时间较短，快的可能几十秒钟就可以完成手术。
种植牙二期的手术过程，首先是将麻药注射在牙槽基底，其次在牙龈上做小切口，大小够放愈合基台即可。接着将种植体平齐骨面的覆盖螺丝拧掉，使种植体呈现中空结构，然后选用合适型号的愈合基台，拧到种植 体内部，即愈合基台安装完毕。如果患者有出血，可咬住棉球压迫止血，如果没有出血，直接回家即可，此外二期手术后不需要口服抗炎药物。