判断甲状腺瘤的良、恶性需要依靠病理诊断，可通过穿刺活检或手术切除的方式，对肿物进行病理检查，以明确肿瘤性质。但对于甲状腺的初步诊断，还是需要通过物理检查，即常见的触诊及超声、CT等影像学检查为主，尤其是超声检查，在临床诊断中更有参考意义，通过超声可以发现甲状腺内是否有不明原因的结节，以及结节的具体部位。
同时可根据结节外观是否光滑，肿物内是否有血运、钙化等超声影像特征，以及颈前是否发现有异常肿大的淋巴结，来对甲状腺结节做出超声性质判断，随着超声和病理学科的不断交叉，超声在一定程度上能区分肿物的良性和恶性。通过超声可以把甲状腺结节分为0-6七个等级，0-3级基本属于良性病变，如果是4级，便有一定的可能性为恶性，尽管超声有一定的辅助效果，但仍然要以病理诊断为基础。