肝门部胆管癌手术切除率相对较低，以前切除率达到10%-15%，虽然现在技术提高，但是对于不同中心、不同医院，不同医生，切除率也不同，所以治愈率不同。肝门部胆管癌经过手术切除，部分患者可以治愈，虽然治愈率相对较低。
现在还能做到R0切除，患者的治愈率可能会稍高，术后还可以做配合辅助治疗、化疗等，使更多患者得到治愈。但是肝门部胆管癌总体治疗效果并不好，因为肝门胆管癌治疗效果多与病理方面有关。肿瘤长在肝门部时切除率相对低，很难做到R0切除，所以治愈率会差。手术要做半肝切除甚至超过半肝的切除，所以属于较大的手术。