临床上应该是指肝内胆管结石和肝外胆管结石的区别，肝内胆管结石是指左右肝管汇合部以上的胆管发生结石，而肝外胆管结石是指左右肝管汇合部以下的胆管发生结石，包括肝总管和胆总管。对于肝内胆管结石来说，大部分没有症状，少部分患者可能具有胆管炎症状，比如腹痛、发烧，还有胆汁淤积引起的胆道梗阻、黄疸症状。
肝内胆管结石和肝外胆管结石的治疗截然不同，肝外胆管结石主要通过ERCP或者外科手术进行治疗，而肝内胆管结石通过ERCP无法处理，需要外科手术进行胆肠吻合、肝叶切除。另外，弥漫性肝内胆管结石，最后还可能需要做肝移植治疗。