精索静脉曲张手术可能有并发症，通常和采用的手术方式相关。传统的精索静脉高位结扎，或腹腔镜下的精索静脉结扎术，可能会出现复发，并发鞘膜积液。但目前采用显微镜下精索静脉结扎术，可以保留动脉和淋巴管，彻底结扎所有静脉，并发症的发生率较低，复发率远远低于传统的高位结扎和腹腔镜下结扎的复发率。因为保留淋巴管，所以鞘膜积液的发生率很低，大概为1%-2%。多数患者术后没有太多并发症，因此建议采用显微镜下的精索静脉结扎术，其效果更好。
如果有些男性由于睾丸疼痛来做手术，应注意精索静脉曲张手术，对于症状的改善不是非常好。因为睾丸或阴囊的症状，除了和精索静脉曲张有关，有时和慢性前列腺炎有关，所以应判断症状和曲张是否有关，再进行治疗。